液相芯片检测体系由许多大小均一的聚苯乙烯圆形微球（直径5.5～8.2 μm）为主要基质构成，这种微球结合了两种不同颜色的荧光染料(红色和橙色)，当微球被635nm的激光照射后，能发射658nm和712nm的荧光。比较二者发射光的比率，最多能够区分100种不同的荧光微球。运用精密的流式细胞技术、数字信号处理器和先进的激光技术，根据事先确定的荧光发射比率，该仪器能鉴定出每一种不同颜色的微球。在分析检测过程中，多色微球可通过羧基与不同的分析物质 (抗原、抗体、寡核苷酸探针等)的氨基结合．加入检测样本充分混合，再和能与报告分子结合的第三种荧光染料(绿色荧光染料PE, Phycoerythrin) 相互作用。开发表面带有均匀羧基基团及结合两种荧光染料(red和infrared)的大小均匀的(直径5.5～8.2 μm）聚丙乙烯磁性微珠。
